矿物学中通常是以矿物药中阴离子为依据对非金属矿物等进行分类，主要有氧化物类(磁石、赭石、信石等)，硫化物类(雄黄、辰砂、自然铜等)，卤化物类(轻粉、大青盐等)，硫酸盐类(石膏、明矾、芒硝等)，碳酸盐类(炉甘石、钟乳石等)，硼酸盐类(硼砂等)和硅酸盐类(滑石等)等。而医药学上通常则以矿物中对药效起重要作用的阳离子为依据，这对矿物药的分类和应用研究有着诸多方便。


按药效活性阳离子分类的非金属矿物

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