SPRIselect加持单细胞测序,揭示CLL患者NK细胞亚群动态

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2025-05-09

2025年4月,厦门大学附属第一医院等机构的研究人员在BMC Cancer上发表文章《Unravelling NK cell subset dynamics and specific gene signatures post-ibrutinib therapy in chronic lymphocytic leukaemia via single-cell transcriptomics》,解析伊布替尼治疗后慢性淋巴细胞白血病患者NK细胞亚群的动态演变及其关键基因特征,为优化免疫治疗策略提供依据。


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研究人员对慢性淋巴细胞白血病(Chronic Lymphocytic Leukemia,CLL)患者的外周血样本(包括初诊、伊布替尼治疗后完全缓解/部分缓解及Richter综合征患者)进行了单细胞转录组测序,结合t-SNE/UMAP聚类分析及轨迹分析,发现NK细胞可划分为CD56bright_NK、CD56dim_NK及CLL_NK三种亚群,其中CLL_NK亚群在治疗后显著增加且高表达细胞毒性基因,并通过轨迹分析证实其为其他亚群的分化前体。


随后,研究人员进一步通过Mendelian随机化和共定位分析筛选出12个与CLL进展相关的关键基因,构建了CLL_NK细胞指数(CNI),发现高CNI与患者肿瘤微环境中免疫细胞浸润水平正相关,并且利用OncoPredict预测及分子对接验证高CNI患者对伊布替尼、氟达拉滨等药物敏感性更强。上述结果表明,CLL_NK亚群的动态演变及其基因特征可为解析伊布替尼治疗机制及优化个体化治疗策略提供关键依据。


研究中单细胞转录组测序作为关键技术为后续复杂分析奠定了基础,单细胞转录组文库构建过程中采用了贝克曼库尔特生命科学SPRIselect核酸片段筛选试剂盒进行cDNA片段和index PCR产物的纯化和双侧片段筛选,去除非目标产物、确保文库片段长度符合测序要求。


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参考文献:

Liu C, Ding T, Zou R, Zhang A, Zhi Z, Wang S. Unravelling NK cell subset dynamics and specific gene signatures post-ibrutinib therapy in chronic lymphocytic leukaemia via single-cell transcriptomics. BMC Cancer. 2025 Apr 21;25(1):745. doi: 10.1186/s12885-025-14166-0.

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